terça-feira, 10 de novembro de 2020

COVID-19 Genomics: pesquisadores reclamam de vieses substanciais e lacunas nos dados de sequenciamento global.

 

Fonte: COVID-19 Genomics , 10 de novembro de 2020

COVID-19 Genomics : Cientistas da Nova Zelândia, Estados Unidos e Austrália demonstraram em um novo estudo a eficácia do sequenciamento genômico em tempo real no rastreamento do ressurgimento de SARS-CoV-2 grave na Nova Zelândia, em agosto deste ano . No entanto, eles apontaram várias deficiências nos dados de sequenciamento Global SARS-CoV-2 atuais disponíveis em vários repositórios de acesso aberto online.



Os pesquisadores geraram os genomas de 80% das amostras confirmadas em laboratório de SARS-CoV-2 do surto de agosto de 2020 na Nova Zelândia e compararam esses genomas com os dados genômicos globais disponíveis.

 

o O sequenciamento genômico foi capaz de identificar rapidamente que os novos casos COVID-19 na Nova Zelândia pertenciam a um único cluster e, portanto, resultaram de uma única introdução. No entanto, a identificação bem-sucedida da origem deste surto foi impedida por vieses substanciais e lacunas nos dados de sequenciamento global.

 

A equipe disse que o acesso a uma amostra mais ampla e heterogênea de dados genômicos globais fortaleceria os esforços para localizar a fonte de quaisquer novos surtos.

 

Os resultados do estudo foram publicados em um servidor de pré-impressão e ainda precisam ser revisados ​​por pares. https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.10.28.20221853v1

 

O novo coronavírus SARS-CoV-2 é o agente responsável pela atual pandemia de COVID-19, que continua a assolar o globo, representando uma ameaça à saúde pública e à economia.

 

A Dra. Jemma Geoghegan da Universidade de Otago em Dunedin, Nova Zelândia, e colegas dizem que o sequenciamento genômico em tempo real identificou rapidamente que os novos casos pertenciam a uma única linhagem genômica e eram, portanto, o resultado de uma única introdução.

 

O sequenciamento do genoma foi usado para informar as medidas de bloqueio e os esforços de rastreamento e rastreamento necessários para controlar o surto e permitir que o vírus fosse eliminado da comunidade pela segunda vez.

 

A equipe de estudo também diz que vieses e lacunas substanciais nos dados de sequenciamento global limitaram o poder da genômica para identificar com sucesso a origem precisa do surto de agosto.

 

A equipe informa que potenciais vieses e lacunas de amostragem nesses dados de sequenciamento devem sempre ser considerados cuidadosamente ao tentar identificar a origem de um surto específico de SARS-CoV-2.

 

A equipe também diz que o acesso a uma amostra mais ampla e heterogênea de dados genômicos globais melhoraria os esforços futuros para localizar as fontes de novos surtos.

 

Houve um rápido progresso no campo da genômica nesta pandemia atual, pois apenas doze dias após o SARS-CoV-2 ter sido identificado pela primeira vez, um genoma do vírus foi publicado e, em 25 de setembro deste ano, mais de 110.000 SARS-CoV -2 genomas foram disponibilizados publicamente.

 

O Dr. Geoghegan disse: “O sequenciamento do genoma subjacente ocorreu tão rapidamente que, pela primeira vez durante um surto de doença infecciosa, permitiu que os dados virológicos e epidemiológicos fossem integrados em tempo real”.

 

É importante ressaltar que o sequenciamento genômico em tempo real desses dados tem sido fundamental para informar a resposta à pandemia, rastreando a transmissão global e a evolução do SARS-CoV-2, incluindo a identificação do número, fonte e tempo de introduções em diferentes países . Houve uma variação significativa entre os países no número e proporção de casos positivos sequenciados e genomas publicados, dizem os pesquisadores.

 

 

 

O Dr. Geoghegan e seus colegas dizem que tais disparidades nos esforços de sequenciamento podem ter implicações importantes para a interpretação dos dados e devem ser consideradas com cuidado.

 

A equipe do estudo disse: “O sequenciamento em tempo real dos genomas do SARS-CoV-2 tem, no entanto, uma utilidade particular no rastreamento do ressurgimento do vírus na Nova Zelândia”.

 

Após o surto inicial no final de fevereiro, o SARS-CoV-2 foi efetivamente eliminado no país em junho, com todos os casos positivos limitados aos vinculados a instalações de quarentena na fronteira.

 

Após mais de cem dias sem transmissão na comunidade detectável, quatro novos casos surgiram em 12 de agosto, nenhum dos quais poderia ser epidemiologicamente relacionado a qualquer caso conhecido.

Nenhum comentário:

Postar um comentário

COVID-19 Ervas: fitoquímicos ácido elágico, ácido gálico, punicalagina e punicalina extraídos de cascas de romã podem inibir o vírus SARS-CoV-2

 Fonte: COVID-19 Herbs, 23 de novembro de 2020 Ervas COVID-19 : Em uma nova pesquisa realizada por cientistas da faculdade de medicina da ...