quinta-feira, 6 de agosto de 2020

NOTÍCIAS DE ÚLTIMA HORA! Mutação COVID-19: Pesquisadores suecos e brasileiros detectam a cepa SARS-CoV-2 com nova mutação importante da proteína Spike

Fonte: COVID-19 Mutation 06/08 2020

Mutação COVID-19 : pesquisadores genômicos do Karolinska Institutet - Suécia e da Universidade Federal de Santa Catarina - Brasil identificaram uma nova mutação em uma cepa do coronavírus 2 da síndrome respiratória aguda grave (SARS-CoV-2) obtida de um paciente em Estocolmo, Suécia, no final de abril.


Os resultados da pesquisa são publicados em um servidor de pré-impressão e estão passando por uma revisão por pares. https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.08.03.233866v1

 

Dr. Tatiany Soratto, professora do departamento de Biologia Celular e Molecular -Karolinska Institutet, diz que é possível que uma mutação desconhecida possa afetar a capacidade do vírus de se ligam às células hospedeiras ou até afetam a gravidade e a progressão da doença.

 

A nova mutação está localizada na superfície da subunidade S1 da proteína spike SARS-CoV-2, a principal estrutura da superfície que o vírus usa para entrar nas células hospedeiras. A subunidade S1 contém o domínio de ligação da enzima 2 de conversão da angiotensina (ACE2) do receptor da membrana da célula hospedeira.

 

A pesquisa também descobriu que dos quatro genomas quase completos reunidos a partir de pacientes infectados, três pertenciam a um dos grupos genéticos que a Agência de Saúde Pública da Suécia havia relatado anteriormente como tendo diminuído a prevalência no final de abril.

 

A equipe do estudo alerta que são necessárias mais investigações para garantir que a disseminação de diferentes cepas de SARS-CoV-2 seja adequadamente caracterizada.

 

Foi relatado que, em 26 de abril, o Dr. Soratto e a equipe coletaram e testaram zaragatoas nasofaríngeas de 23 pacientes com suspeita de COVID-19 no Hospital Universitário Karolinska, em Estocolmo, Suécia.

 

Desses pacientes, dezessete foram confirmados como positivos para SARS-CoV-2 pelo teste de reação em cadeia da transcriptase reversa-polimerase (RT-PCR). Após extrair o RNA viral e sintetizar o DNA complementar, foram geradas bibliotecas com fragmentos de 350 pares de bases (bp) e preparadas para o seqüenciamento de espingarda.

 

Ao remover sequenciadores e adaptadores de baixa qualidade e a referência do genoma humano, os pesquisadores mapearam as leituras restantes para o genoma completo do SARS-CoV-2 Whuan-Hu-1, conforme acessado no GenBank.

 

Quando o mapeamento foi concluído, a Genome Detective Virus Tool foi usada para montar as leituras com o genoma GenBank SARS-CoV-2 usado como referência, e variantes de nucleotídeo único foram atribuídas a cada genoma.

 

A equipe do estudo conseguiu reunir quatro genomas quase completos que cobriam 99,7 a 99,8% do genoma de referência do GenBank e toda a região de codificação.

 

Quando comparados com o genoma de referência, cada um dos quatro genomas reunidos tinha entre 9 e 14 variantes de nucleotídeos.

 

A equipe do estudo relata que todos os quatro genomas tiveram mutações na posição não codificadora 241 C (citosina) para T (timina) e três mutações nas regiões codificantes, que eram duas C para T em 3037bp e 14408bp e ​​uma A (adenina) em G (guanina) em 23403 pb.

 

No entanto, em um dos genomas, uma variante foi encontrada em 23463 pb que não foi encontrada em nenhum outro genoma do GenBank SARS-CoV-2. A mutação altera um resíduo de arginina para um resíduo de histidina na posição 364 na subunidade S1 da proteína de pico viral.

 

Os pesquisadores genômicos dizem que essa variante da proteína spike pode ter efeitos desestabilizadores.

 

O Dr. Soratto disse: "A variante está localizada na superfície da subunidade S1 e pode afetar a ligação do virion à célula, mesmo que não altere o próprio domínio de ligação ao receptor".

 

Ao comparar os quatro genomas de SARS-CoV-2 obtidos de pacientes em Estocolmo com os detectados globalmente, os pesquisadores descobriram que eles pertenciam às linhagens genéticas 20C / B.1 / G e 20B / B.1.1 / GR.

 

A Agência de Saúde Pública da Suécia havia relatado anteriormente esses grupos genéticos como duas das três principais linhagens encontradas na Suécia.

 

Porém, três dos genomas são do grupo B.1 / G, que também foi relatado pela Agência de Saúde Pública da Suécia como tendo diminuído sua prevalência no final de abril, dizem Soratto e equipe.

 

Ele acrescentou: "Essa linhagem se espalhou para mais de 20 países da Europa, Américas, Ásia e Austrália e corresponde ao surto italiano".

 

Os pesquisadores alertaram: "É necessária mais investigação para garantir que a disseminação de diferentes tipos de SARS-CoV-2 seja totalmente caracterizada".

 

A equipe de estudo, juntamente com outros pesquisadores globais, está estudando a cepa mutada e rastreando outras linhagens ou linhagens ou casos a ela associados, enquanto estuda suas capacidades de ligação e implicações na progressão da doença, bem como na pesquisa de anticorpos, vacinas e medicamentos.

 

Deve-se notar que o vírus sofre numerosas mutações menores à medida que se espalham de um hospedeiro para outro, pois existem centenas de variedades diferentes. No entanto, quando uma mudança significativa é observada em seu RNA, a mutação é considerada importante e merece mais estudos.

 

O Thailand Medical News apresentará relatórios sobre os desenvolvimentos desta pesquisa.

 

Para saber mais sobre a mutação COVID-19 , continue acessando.


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